El Consell Esportiu de la Cerdanya és una entitat privada sense ànim de lucre, que  es regeix per principis democràtics i representatius.  Els òrgans de representació, govern i administració del Consell Esportiu de la Cerdanya són l'Assemblea General, la Comissió Directiva i el President.

L'Assemblea General és l’òrgan superior de govern  i està integrada per les entitats esportives, els centres escolars i les institucions públiques que participen en l’activitat esportiva en edat escolar. 

Són funcions de L’Assemblea:

• Marcar les línies generals d'actuació

• Elegir els seus representants.

• Aprovar els pressupostos i controlar la seva aplicació.

• Nomenar una comissió permanent com a òrgan d’execució que es denominarà “Comissió Directiva”.

El Consell Esportiu de la Cerdanya es regeix pels seus estatuts.